Senteret ligger i Rosendal og har fokus på vannets syklus på Jorden. Folgefonnsenteret er et senter for forskningsbasert kunnskapsformidling omkring tema knyttet til Folgefonna, landskapet og fjordsystemene rundt Folgefonnhalvøyen.
Senteret er faglig forankret i Havforskingsinstituttet, Bjerknessenteret/UiB og Besøkssenter nasjonalpark Folgefonna.